Delphine Cascarinos skott i den 27:e minuten träffade Eriksson och ställde målvakten Ann-Katrin Berger.
Det var svenskans andra självmål på kort tid. Hon gjorde självmål när Manchester City vann FA-cupsemifinalen i förra veckan.
Amandine Henry gjorde 2–0 i den 39:e minuten på hörna. Dzsenifer Marozsán slog en skruvad hörna och Henry touchade bollen innan den gick i mål.
Tjugo minuter från slutet reducerade Chelsea, som förutom Eriksson även startade med Jonna Andersson, genom ett snyggt skott av Erin Cuthbert. Ett viktigt bortamål inför returen hemma i London om en vecka.
Lyon har vunnit Champions League de tre senaste åren. I år slog de ut fjolårsfinalisten Wolfsburg redan i kvartsfinal (totalt 6–3). Chelsea gick till semifinal genom en totalseger med 3–2 över Paris Saint-Germain.
Även den tredje svenska landslagsspelaren i CL-semifinal, Fridolina Rolfö, blev förlorare i den första matchen. Hennes Bayern München förlorade hemma mot Barcelona med 0–1.
Fridolina Rolfö hade som vanligt många chanser för Bayern, men hade svårt att få bollen inom målramen.
I den 63:e minuten spräcktes målnollan – för bortalaget. Kheira Hamraoui sköt bollen i mål vid bortre stolpen. Hemmalagets Sara Däbritz hade en bra målchans på frispark i den 90:e minuten, men bollen tog i ribban. En stund senare sköt hon också över.
Det är första gången som Bayern München gått till semifinal i Champions League. Barcelona förlorade i semifinal 2017.