Samtidigt ska centralbanken få nya befogenheter och flera nya departement skapas under regeringen.
Omorganisationen är en hörnpelare i Kinas president Xi Jinpings agenda för att stärka Kommunistpartiets och därmed sin egen kontroll över ekonomin och marknaden.
"Att stärka partiets övergripande ledarskap är huvudsaken", skriver Liu He, presidentens högsta ekonomiska rådgivare i en kommentar i den statskontrollerade tidningen Folkets dagblad.
Beskedet kommer sedan Kinas konstitution i söndags ändrades så att Xi Jinping nu kan sitta kvar som president på livstid.
Myndighetsreformerna innebär bland annat att centralbanken tar ansvar för den så kallade makrotillsynen medan den nya sammanslagna tillsynsmyndigheten för finanssektorn fokuserar på praktisk reglering
Kinas bank- och finanssektor beräknas vara värd nästan 350000 miljarder kronor. De finansiella tillgångarna i Kina motsvarar nästan fem gånger landets bruttonationalprodukt, enligt Internationella valutafonden (IMF).
Vilka personer som ska leda de nya departementen och myndigheterna kommer att klargöras under kommande vecka.